种子不同，性质不同，外稃不同，谷壳厚度不同。

巨型稻的种子的腹部呈凹型，普通稻谷种子的腹部呈直线。

巨型稻可以在优良水稻品种进行杂交，普通水稻属于谷类作物。

巨型稻的外稃和内稃交界处有一个小黑圆点，普通稻谷没有小黑圆点。

巨型稻的谷壳比较轻薄，普通稻谷的谷壳比较厚。