根据小瓜虫的生活史，进行治疗时，一要杀死鱼体上的寄生虫，二要杀死从胞囊中破囊而出的自由游泳幼虫和脱离鱼体的成熟寄生虫，三要杀死胞囊，这样才能算彻底根治。

但可惜的是，至今都没有能杀灭寄生于鱼体，而对鱼体无害、对池水无污染的药物。

由此可见，一次治疗是难以达到理想疗效的，除非病情轻，或者是所用药物可同时杀死潜伏表皮之下的寄生虫和胞囊