南京市区是可以摩托车行驶的，但前提是你的摩托车必须是南京市区的牌照，外地车牌含南京郊区的摩托车是禁止在市区道路上行驶的（绕城公路以内），否则罚款2000并处拘留，但南京市区牌照现在市停办的，只有以前办的牌照在流通，所以实际上南京市禁摩的。