西南大医学院没有临床医学专业。只设置了化学药学，生物药学，中药学，药理学，药物制，药物分析学，和制药工程7个教研室。总的来讲，西南大学医学院目前实力不是很强，还处于一个初始发展阶段。与学校其它强势学科相比，如师范，农业学科差距还比较大。