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EM菌是一类复合微生物菌群，是由光合细菌、酵母菌、乳酸菌、放线菌等5科10属共计80余种有益菌复合培养而成的微生态制剂，是日本琉球大学比嘉照夫教授等多年潜心研究的成果，产品于20世纪80年代初投放市场。

EM菌在水产养殖中有广泛的应用。该产品能快速降解、吸收和转化水体中的氮、磷和有机污染物，形成优势种群后，还能有效抑制有害微生物和有害藻类的生长繁殖。