宫女杀嘉靖帝的原因在于嘉靖帝对宫女的迫害。嘉靖帝喜欢炼丹，需要童女的月经血，于是嘉靖帝从民间强征女孩，逼迫她们服用催经血的药物，造成很多宫女血崩死亡。

同时，嘉靖帝因修道而脾气暴躁怪异，宫女经常无故被杀，让宫女们对嘉靖帝又恨又怕。因此，以杨金英为首的宫女才决定杀嘉靖帝。