木星上的大气层是对流层，平流层，热层和系外层。

由于木星缺乏固体表面，所以科学家们定义大气压力为一百帕的点为其底部。大气层的压力在这个点之上。和地球一样的是，大气层的温度随着高度的上升而下降，直到最小值。这是对流层顶，距离木星“表面”大概50公里的地方，定义了对流层与平流层之间的边界。