有两种方式，即底物水平磷酸化氧化磷酸化。

1、作用物水平的磷酸化：

代谢过程中产生的高能化合物可直接将其高能键中贮存的能量传递给ADP，使ADP磷酸化形成ATP。

2、氧化磷酸化：

在电子传递过程中发生ADP磷酸化，这也是ATP生成的主要方式。由代谢物脱下的氢通过呼吸链传递给氧生成水，同时逐步释放能量，使ADP磷酸化生成ATP.呼吸链电子传递的氧化过程与ADP磷酸化、生成ATP相偶联的过程称氧化磷酸化。