虽然采购方式是由采购人选择，但代理机构对采购人选择方式上的影响不可谓不大。首先，国家对代理公司资格认定上的新政使得代理公司数量剧增，代理机构从业人员业务能力参差不齐，对采购人在采购过程中的指引、服务等能力欠缺。

其次，招标代理公司毕竟是盈利性质的采购业务代理机构，采购程序上的复杂程度决定项目评审的效率，也决定了代理公司的利润比率。竞争性磋商介于公开招标与竞争性谈判两种采购方式之间，又是新生事物，在程序把控上没有公开招标和竞争性谈判简单、运用自如。