区别一、基本释义不同

巡防：1、巡逻防护。2、巡视边防。

巡逻：行走查看警戒。

区别二、引证出处不同

巡防：《宋史·刑法志一》：“若驱虏官吏巡防人等，不以伤与不伤，凡情不可贷者，皆处以死刑。”

巡逻：太平天囯 洪秀全 《全军放胆杀敌诏》：“日夜巡逻严预备，运筹设策夜衔枚。”