金陵十三钗是南京人，金陵是南京的古称，公元前333年，楚威王熊商于石头城筑金陵邑，金陵之名源于此。南京被日军入侵，城市化为一片废墟，一群女大学生和十三个位秦淮河上的风尘女子一起避难于教堂。

日军要求教堂交出十三个女学生，风尘女子为了保护国家的人才，选择代替她们去赴约，最后这十三个人被当成慰安妇，其余十二人被杀害，只有墨玉活了下来，后出庭做证日本的残忍暴行。