区别一、释义不同

章程：是组织、社团经特定的程序制定的关于组织规程和办事规则的规范性文书，是一种根本性的规章制度。

纲要：大纲要领。

区别二、引证出处不同

章程：宋 王禹偁《谏议大夫臧公墓志铭》：“又雅善音律、章程之伎，为时辈所推服。”

纲要：清 侯方域 《太平仁义之效论》：“惟 光武 有人君之度，而躬亲吏事，失其纲要。”