青苔鼠鱼主要以水草和藻类食物喂食，人工饲养时可给它喂食沉底形饵料以方便它进食。青苔鼠鱼也能吃鱼缸上的水草既能补充营养又能达到清洁水缸的作用。饲养青苔鼠鱼时，每天给它喂食2～3次即可，喂食完后需及时清理水缸，避免食物残渣污染水质。