中山大学深圳校区毕业证一样的。

中山大学深圳校区是2015年11月3日由深圳市人民政府与中山大学签署共建世界一流大学战略合作协议的重要成果，2015年12月由教育部批准建设，是中山大学三校区五校园的主体校园之一。深圳校区属于中山大学直属校区。