鄱阳湖流域为亚热带季风气候，夏季高温多雨、冬季温和少雨。年内降水变率大，造成湖水水位变化大。即夏季赣江等河流进入汛期，鄱阳湖水位高冬季河流为枯水期，湖水水位低。湖泊水位维持至10月开始稳定下降，至次年1到2月水位降至最低点。