高中生工藤新一在跟踪黑衣组织时被琴酒发现打晕了，被黑衣组织惯下了不明的药物，然后变小了身体，醒过来后去到了博士家，在他和博士的交谈之际，小兰的到来让博士和新一慌了神，在慌忙之中，变小的新一躲到了橱子后面，他因为戴眼镜弄出了声响，小兰发现了他，问他叫什么名字，在他不知所措时取名叫柯南。