1、功能不同。社保卡不仅具有医保卡功能，还是办理各项社保业务的重要凭证，例如领取失业金等等。但医保卡仅限于医保功能，只能用来享受医保待遇。

2、发卡部门不同。医保卡由当地指定代理银行承办，而社保卡由各地人力资源和社会保障部门面向社会发行。

3、安全性能不同。社保卡有较为严格的密钥管理体系和审批，安全系数较高而医保卡则没有这种管理体系，安全系数较低。