杭州东站的地铁換乘可以分为同站和出站換乘：杭州地铁1号线和杭州地铁4号线可以同站换乘，也就是说可以从杭州地铁1号线下车后，直接到对面去換乘同方向的杭州地铁4号线杭州地铁1号线和杭州地铁6号线要出站換乘，也就是说可以从杭州地铁1号线下车后，要去另一个杭州东站的站台去换乘6号线。