三元鲜牛乳和鲜牛奶主要的区别在于鲜牛乳是新鲜的，刚从牛身上挤出的奶，是一种原料奶，其未经过任何加工、消毒等处理鲜牛奶是指经过煮沸、杀菌消毒后的牛奶。鲜牛乳不可直接饮用，因为奶中含有大量病菌等有害物质，而鲜牛奶可以直接饮用，不会造成病菌感染等情况。