不能。亚甲基蓝在实际的使用过程当中并没有去除褐藻的作用。亚甲基蓝的主要作用是出水，没它对于水体当中的水霉菌具有非常好的杀灭作用，同时，亚甲基来也可以作为日常检疫的药剂来进行使用。在实际操作过程当中，如果想要去除褐藻，我们只需要用干净的百洁布将其擦除掉即可。