支付宝付款码和乘车码的区别是：付款码是向商家付款的二维码，当商家用扫描枪扫描了这个付款码后就可以扣买家的付款了。而乘车码是公交公司与支付宝协议后给每人办理了乘车卡的人给的一个二维码，用公交车上的扫码设备扫这个码后就扣了乘客的车票款。