甲型流感病毒的M2是由病毒RNA片段7剪切的mRNA编码的97个氨基酸残基组成的Ⅲ型膜内在蛋白（type Ⅲ integral membrane Proteins），它被证明是由低pH激活的质子（H）选择性的离子通道（proton-selective channel），是人们研究最深入的病毒离子通道。

流感病毒M2蛋白通过氢离子通道活性阻断细胞自噬体与溶酶体的融合，从而抑制细胞自噬降解的重要机理。