仓库被洪水淹了保险公司一定会赔的。洪水属于保险责任，如果投保了企业财产保险，可以向保险公司报案索赔。保险公司会第一时间赶到受灾现场，对受灾财产提出施救措施，并登记受灾物品，察看企业财务明细账，明确理赔金额及仓库维修费用。及时给予赔付。