区别一、释义不同

员工：职员和工人。

职工：①职员和工人，泛指工作人员。②旧指工人。

区别二、引证出处不同

员工：汉语词典。

职工：杜鹏程 《在和平的日子里》第一章：“只有在后半夜，大气中的热力减退了，除了上班的职工以外，大伙都躺在江边、路旁或者帐篷里，呼呼地睡觉。”