机关内设科室的设置主要是根据单位编制、承担的任务和职能等方面的规定而确定。

机关内设机构一般由综合科室和业务科室组成。综合科室的设置大多相似，比如办公室、人事科、宣传（信息）科等，业务科室根据职责分工和工作需要而设置，主要是分类别、职责情况而定，目的是为了更好的完成任务，防止出现工作和职能交叉以及履职出现空档。