国三摩托车协议年审流程如下：  

1、携带身份证、驾驶证、行驶证、强制保险单同时将摩托车开到指定的车辆检测现场进行报名与检验  

2、领取并填写《机动车查验记录表》和《机动车验证申请表》  

3、摩托车经过验车后，更改行驶证，缴纳相关年检费用。