有一个区别，5－羟色氨酸在色氨酸的基础上在五号碳上挂了一个羟基。5-羟色氨酸在机体脱羧酶的作用下可生成5－羟色胺。调节人体代谢活动。色氨酸也能生成5-羟色胺，只不过要进行脱羧酶和加羟酶的作用。