主要区别是，高本贯通院校在高考招生时有与本科院校联合培养本科生的招生计划，学生在高职院校就读，考试合格毕业时发本科文凭，学制一般为3+2年，专科院校的毕业生只能通过专升本后到本科院校就读，毕业考试合格发本科文凭。

高本贯通院校与专科院校的区别

专科院校的学生毕业后拿的是专科毕业证，高本贯通的学生先在专科学校上三年专科，再到对应的本科学校上学，毕业后拿的是本科毕业证