羊穿芯片和核型有作用不同、效果不同等区别。羊水穿刺、羊水芯片都是用来检测胎儿染色体是否异常，两者间互有不同但又互为补充。羊水穿刺后取得的标本，可以用于染色体核型分析、基因芯片检查等。