复旦大学在上海，厦门大学在厦门。两所大学都是教育部直属的著名大学，都是211和985大学，国家重点建设的双一流大学。从两所大学的基本信息和师资力量以及各种大学的排名来看，复旦大学都在厦门大学的前面，所以，复旦大学的实力要更强一些。