南昌西站站房共分为地下三层、地上两层。南昌西站的地面一层（进站及购票区）为广场进站层，设南北站房、中部进站广厅和基本站台候车区，两侧为售票厅、服务区及贵宾区。

南昌西站的地上二层（商业购物及餐饮）为高架候车层，由高架道路、售票厅、中部候车区组成，并设有商业服务夹层。商业区目前主要设有两个西式快餐店，一个中式快餐店，一个工艺品店，一个书店和一个咖啡厅。