1、定义不同

隶属关系是指在类目表中下位类一定要带有上位类的属性，上位类一定能包含它所属的各级下位类。而同一专业系统中上级主管业务部门与下级主管业务部门之间是指导与被指导关系。

2、含义不同

隶属关系的含义是指劳动者成为用人单位中的一员，即当事人成为该用人单位的职工或员工。而指导关系指的是上下级行政机关之间的一种行业或业务上的指导与监督关系。在指导关系中，上级主管部门享有业务上的指导权和监督权，但没有对下级行政机关的直接命令、指挥权。