科莫多巨蜥在自然界没有天敌。只有人类活动对科莫多巨蜥的生存环境产生重大影响，会导致其逐步走向灭绝之路。在大自然中，科莫多巨蜥一般食用动物尸体，属食腐类，但也可通过有多种病菌的唾液撕咬攻击其他动物，致其感染死亡后再去猎食。怀孕的母鹿也是其食谱中的佳肴。