脂质体结构主要是根据脂质体所包含类脂质双分子层的层数来分的，一般可分为单室脂质体和多室脂质体。

含有单一双分子层的泡囊称为单室脂质体或小单室脂质体(SUVs)，其粒径约10～80nm大单室脂质体(LUVs)为单层大泡囊，粒径在100～1000nm之间含有多层双分子层的泡囊称为多室脂质体(MLVs)。