孔雀鱼幼鱼跟母鱼、公鱼都不像的，就是一般幼鱼的模样，压成体的时候可以比较明显的分出公母。这时候的体形就会体现出性别差异了。

由于孔雀鱼的品种、颜色等方面的区别，有些孔雀鱼可能会难以从体形，体色和胎斑分出公母。那么可以用一个最为直接和很准确的方法来分公母：公孔雀鱼肛门处的一根鱼鳍程针状，母孔雀鱼肛门处的一根鱼鳍呈三角形（或者叫扇形）