牧神记小说中司婆婆跟秦牧没有在一起。

牧神记小说中司婆婆最后没有跟秦牧在一起，司婆婆和秦牧年轻时是一对情侣，但是两人因为一些误会导致分手，随后秦牧进入人间界隐居，直到秦羽来到上界修行的时候秦牧才跟着一起返回上界，最后司婆婆和秦牧虽然再次见面但是早已没有年轻时的那份冲动，虽然双方都原谅了彼此，但是最终没有走到一起。