大运河流经扬州的辖区包括:邗江、广陵、江都、高邮、宝应。

京杭大运河与长江交汇于扬州。当年隋炀帝大规模全线开凿京杭大运河，就是以扬州为中心，在邗沟的基础上进行南北扩掘和连接的。

春秋吴王夫差十年(公元前486)开凿邗沟（从江都（今扬州市）邗口至山阳（今淮安市）淮安末口），以通江淮。至战国时代又先后开凿了大沟(从今河南省原阳县北引黄河南下，注入今郑州市以东的圃田泽)和鸿沟，从而把江、淮、河、济四水沟通起来。