公孔雀鱼身体的色彩更丰富，颜色比母孔雀鱼更加艳丽，母孔雀的主要任务是产崽，相对公孔雀鱼来说，就没有那样艳丽的色彩了，从这点上很容易看出孔雀鱼的公母。

公孔雀鱼的腹部是纯白色，而母孔雀鱼则是透明的。孔雀鱼公母的腹部颜色是不同的，母孔雀鱼一看就能够认出来，因为它是透明的腹部，能够看到内部的情况。