一般是晒干保存，当然短期内也可以密封放在冰箱冷藏保存。

用木桶盛装砂仁，置于烟灶上，用湿麻袋盖密桶口，升火熏烟，至砂仁发汗(即果皮布满小水珠)时，取出摊放在竹筛或晒场上晒干。

或者将鲜果装于焙筛中，厚约10厘米，送入烤房先于90℃~100℃高温烘烤2~3小时杀青。然后停止加热，让其在余热中保持半小时后，打开烤房门放气降温，使果皮收缩。也可杀青后连筛取出置地上冷却收缩后，再装回烤房在80℃烘干。