香砂仁和毛砂仁主要在外形、作用上有所不同，具体的区别为：1、外形不同。香砂要大一点，外皮相对砂仁要薄一些而砂仁小，外皮厚、坚硬。

2、作用不同。香砂仁具有化湿开胃，温脾止泻，理气安胎的功效，有极高的药用价值而毛砂仁主治脾胃气滞，宿食不消，腹痛痞胀，噎膈呕吐，寒泻冷痢。

3、主要分布地不同，仁香砂主要分布贵州罗甸、云南昭通、大理，四川宜宾，泸州等地区而毛砂仁分布于中国福建、广东、广西和云南栽培或野生于山地荫湿之处。