有区别。C盘是系统盘，一般都安装系统相关程序。

如果其它软件也安装到C盘中，除了使用时间长了，安装软件多了，会影响系统运行性能外，万一以后重装系统，也因数据安全问题，极其不方便。

如果非系统软件都安装到其它分区（除了C盘外的任何盘都没问题），那么安装了多少软件，使用时间长了产生的垃圾等问题，都不会太大影响C盘中的系统文件。