杀菌的方法不一样。

巴氏鲜奶的消毒方法为巴氏杀菌法，是利用病原体不是很耐热的特点，用适当的温度和保温时间处理，将其全部杀灭。但经巴氏消毒后，仍保留了小部分无害或有益、较耐热的细菌或细菌芽孢。

自己煮的鲜奶的消毒方法为高温消毒法。