二者的主要区别就是在于羊的饲养方式、饲料和羊奶处理过程。

出产有机羊奶的羊是在天然牧场中放养、吃天然牧草长大的，它们所吃的牧草施的也都是天然肥料。只有这样，有机羊所产的有机羊奶才能最大限度保存它天然营养成分。在羊奶的后期加工中，也不加入防腐剂、抗生素等物质。