看情况而定。首先看职工因为什么原因入院。一般分为三种情况。

一是工伤

二是职业病住院

三是自己生病住院。看情况而定。一般是前两种情况会将医院证明放入员工个人档案里，个人生病住院不会将医院证明放入员工档案里，但员工入职时体检报告一般会放入员工个人档案里。