主要有以下几点区别：

1、效率：机要比专人提取慢。

2、安全性：机要更安全、可靠，因为机要采用的是专人押送，相对于专人提取来说更加安全，可靠。

3、业务办理：专人提取自己就能办理邮寄业务，但个人不能办理机要邮寄业务，机要仅针对国企、事业单位开放，不对个人以及民企私企开放。

4、查询：EMS快递可以通过快递单号在网上查询物流，但机要不能公开查询。