两者的区别在于档案的价值或判定档案价值的标准不同。一般档案的价值是由档案的形成者确定的，如只要形成者认为有保存利用价值，文件材料便可成为档案。因此，一般档案的范围十分宽泛。但是，机要档案必须“对国家和社会有保存价值”，其范围小于一般档案，是一般档案中的一部分。