甘肃省企业医保网上申办流程：缴费单位签订银行代扣代缴协议后，向地税机关申请网络申报业务，经核准后接受培训。

申报时持地方税务机关提供账号及密码登陆地方税务局网上办税系统，自行进行缴费申报并在网上办税系统自行扣缴社保费。