市医保和区医保的区别就是：

1、市医保卡只能在乌鲁木齐市范围内使用，区医保卡可以在全疆范围内使用。

2、报销比例和大病统筹方面是有差别，具体是多少不是很清楚。相关规定可以在办理的时候咨询下，但有一点可以明确的是区医保要比市医保好一点，办理上面的要求你最好找社保中心问下，118114就可以问到的。