农村办理医保卡的程序是，带上户口本、身份证到所在村委会办理，交费，办理医保卡，村委会把办理医保所有村民造册，录入电脑，然后医保花名册、及参保金额全部上交镇的劳动管理所，最后累计全镇参保人员以及金额上报市社保局。