将航天飞船取名为“神舟”，是很慎重的事。据中国航天科技集团公司透露：我国载人航天工程肇始于1990年代初期。当年给飞船命名，有关部门曾提出过好几个方案，在集团公司、中科院、中国人民解放军总装备部等单位反复征求意见，最后选定了“神舟”二字。为什么选择这一名称呢主要有两点考虑——一是“船”在汉语里又称“舟”，用“神舟”来命名遨游神秘太空的宇宙飞船，既形象又贴切

二是“神舟”谐音“神州大地”的“神州”，一语双关，寓意中国的腾飞。